Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AlkP97793 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AlkP97793 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AlkP97793 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AlkP97793 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AlkP97793 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AlkP97793 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AlkP97793 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
AlkP97793 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AlkP97793 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AlkP97793 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AlkP97793 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AlkP97793 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AlkP97793 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AlkP97793 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AlkP97793 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
AlkP97793 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AlkP97793 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AlkP97793 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AlkP97793 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
AlkP97793 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AlkP97793 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AlkP97793 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AlkP97793 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AlkP97793 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AlkP97793 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AlkP97793 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AlkP97793 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
AlkP97793 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AlkP97793 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AlkP97793 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AlkP97793 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AlkP97793 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AlkP97793 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
AlkP97793 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AlkP97793 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AlkP97793 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AlkP97793 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AlkP97793 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AlkP97793 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AlkP97793 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AlkP97793 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
AlkP97793 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
AlkP97793 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AlkP97793 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AlkP97793 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
AlkP97793 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
AlkP97793 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AlkP97793 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AlkP97793 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AlkP97793 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
AlkP97793 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AlkP97793 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AlkP97793 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AlkP97793 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
AlkP97793 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AlkP97793 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AlkP97793 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AlkP97793 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AlkP97793 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AlkP97793 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AlkP97793 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AlkP97793 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
AlkP97793 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AlkP97793 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
AlkP97793 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AlkP97793 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AlkP97793 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AlkP97793 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AlkP97793 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AlkP97793 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AlkP97793 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AlkP97793 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AlkP97793 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AlkP97793 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AlkP97793 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AlkP97793 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
AlkP97793 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
AlkP97793 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
AlkP97793 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
AlkP97793 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
AlkP97793 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
AlkP97793 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
AlkP97793 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
AlkP97793 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
AlkP97793 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
AlkP97793 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
AlkP97793 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
AlkP97793 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
AlkP97793 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
AlkP97793 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AlkP97793 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AlkP97793 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AlkP97793 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AlkP97793 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AlkP97793 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AlkP97793 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AlkP97793 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AlkP97793 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AlkP97793 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms