Protein–RNA interactions for Protein: P97357

Taf1a, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1aP97357 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf1aP97357 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf1aP97357 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf1aP97357 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf1aP97357 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf1aP97357 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf1aP97357 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1aP97357 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1aP97357 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1aP97357 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1aP97357 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1aP97357 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1aP97357 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1aP97357 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1aP97357 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1aP97357 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1aP97357 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1aP97357 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1aP97357 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1aP97357 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1aP97357 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1aP97357 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1aP97357 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1aP97357 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1aP97357 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1aP97357 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1aP97357 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1aP97357 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1aP97357 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1aP97357 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1aP97357 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1aP97357 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1aP97357 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1aP97357 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1aP97357 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1aP97357 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1aP97357 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1aP97357 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1aP97357 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1aP97357 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1aP97357 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1aP97357 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1aP97357 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1aP97357 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1aP97357 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1aP97357 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1aP97357 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1aP97357 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Taf1aP97357 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Taf1aP97357 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Taf1aP97357 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Taf1aP97357 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Taf1aP97357 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Taf1aP97357 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Taf1aP97357 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1aP97357 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1aP97357 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1aP97357 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1aP97357 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1aP97357 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1aP97357 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1aP97357 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1aP97357 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1aP97357 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1aP97357 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1aP97357 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1aP97357 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1aP97357 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1aP97357 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1aP97357 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1aP97357 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1aP97357 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1aP97357 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1aP97357 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1aP97357 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1aP97357 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1aP97357 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1aP97357 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1aP97357 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1aP97357 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1aP97357 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1aP97357 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1aP97357 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1aP97357 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1aP97357 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1aP97357 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1aP97357 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1aP97357 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1aP97357 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1aP97357 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1aP97357 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf1aP97357 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf1aP97357 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf1aP97357 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf1aP97357 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf1aP97357 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf1aP97357 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf1aP97357 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf1aP97357 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf1aP97357 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms