Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkp1P97350 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pkp1P97350 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
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