Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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