Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad50P70388 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad50P70388 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad50P70388 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad50P70388 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad50P70388 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad50P70388 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad50P70388 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad50P70388 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad50P70388 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad50P70388 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad50P70388 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad50P70388 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad50P70388 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad50P70388 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad50P70388 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad50P70388 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad50P70388 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad50P70388 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad50P70388 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad50P70388 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad50P70388 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad50P70388 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad50P70388 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad50P70388 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad50P70388 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad50P70388 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad50P70388 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad50P70388 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad50P70388 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad50P70388 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad50P70388 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad50P70388 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad50P70388 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad50P70388 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad50P70388 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad50P70388 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad50P70388 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad50P70388 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad50P70388 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad50P70388 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad50P70388 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad50P70388 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad50P70388 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad50P70388 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad50P70388 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad50P70388 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad50P70388 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad50P70388 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad50P70388 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad50P70388 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad50P70388 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad50P70388 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad50P70388 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rad50P70388 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rad50P70388 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad50P70388 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad50P70388 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms