Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad54lP70270 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad54lP70270 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad54lP70270 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad54lP70270 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad54lP70270 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad54lP70270 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad54lP70270 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad54lP70270 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad54lP70270 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad54lP70270 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad54lP70270 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad54lP70270 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad54lP70270 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rad54lP70270 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rad54lP70270 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rad54lP70270 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Rad54lP70270 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rad54lP70270 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rad54lP70270 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rad54lP70270 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms