Protein–RNA interactions for Protein: P70211

Dcc, Netrin receptor DCC, mousemouse

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DccP70211 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DccP70211 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DccP70211 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DccP70211 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DccP70211 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DccP70211 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DccP70211 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DccP70211 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DccP70211 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DccP70211 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DccP70211 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DccP70211 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DccP70211 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DccP70211 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DccP70211 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DccP70211 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DccP70211 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DccP70211 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DccP70211 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DccP70211 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DccP70211 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DccP70211 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DccP70211 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DccP70211 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DccP70211 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DccP70211 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DccP70211 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DccP70211 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DccP70211 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DccP70211 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DccP70211 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DccP70211 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DccP70211 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DccP70211 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DccP70211 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DccP70211 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DccP70211 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DccP70211 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DccP70211 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DccP70211 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DccP70211 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DccP70211 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DccP70211 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DccP70211 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DccP70211 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DccP70211 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DccP70211 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DccP70211 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DccP70211 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DccP70211 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DccP70211 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DccP70211 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DccP70211 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DccP70211 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DccP70211 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DccP70211 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DccP70211 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DccP70211 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DccP70211 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DccP70211 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DccP70211 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DccP70211 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DccP70211 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DccP70211 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DccP70211 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DccP70211 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DccP70211 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DccP70211 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DccP70211 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DccP70211 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DccP70211 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DccP70211 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DccP70211 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DccP70211 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DccP70211 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DccP70211 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DccP70211 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DccP70211 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DccP70211 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DccP70211 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DccP70211 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DccP70211 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DccP70211 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DccP70211 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DccP70211 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DccP70211 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DccP70211 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DccP70211 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DccP70211 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DccP70211 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DccP70211 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DccP70211 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DccP70211 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DccP70211 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DccP70211 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DccP70211 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DccP70211 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DccP70211 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DccP70211 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DccP70211 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms