Protein–RNA interactions for Protein: P63276

Rps17, 40S ribosomal protein S17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps17P63276 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps17P63276 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps17P63276 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps17P63276 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps17P63276 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rps17P63276 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms