Protein–RNA interactions for Protein: P62702

Rps4x, 40S ribosomal protein S4, X isoform, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps4xP62702 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Rps4xP62702 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps4xP62702 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms