Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smg6P61406 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smg6P61406 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smg6P61406 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms