Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psme3P61290 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psme3P61290 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Psme3P61290 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme3P61290 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme3P61290 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme3P61290 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme3P61290 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms