Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snap25P60879 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Snap25P60879 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snap25P60879 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Snap25P60879 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snap25P60879 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snap25P60879 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Snap25P60879 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms