Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hps5P59438 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hps5P59438 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hps5P59438 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hps5P59438 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hps5P59438 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hps5P59438 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hps5P59438 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hps5P59438 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hps5P59438 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hps5P59438 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hps5P59438 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hps5P59438 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hps5P59438 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hps5P59438 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hps5P59438 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hps5P59438 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hps5P59438 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hps5P59438 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hps5P59438 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Hps5P59438 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hps5P59438 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hps5P59438 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hps5P59438 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hps5P59438 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hps5P59438 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hps5P59438 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hps5P59438 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hps5P59438 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hps5P59438 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hps5P59438 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Hps5P59438 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Hps5P59438 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Hps5P59438 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hps5P59438 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hps5P59438 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hps5P59438 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hps5P59438 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hps5P59438 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hps5P59438 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hps5P59438 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hps5P59438 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hps5P59438 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hps5P59438 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hps5P59438 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hps5P59438 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hps5P59438 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hps5P59438 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hps5P59438 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hps5P59438 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hps5P59438 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hps5P59438 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hps5P59438 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hps5P59438 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hps5P59438 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Hps5P59438 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hps5P59438 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hps5P59438 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hps5P59438 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hps5P59438 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hps5P59438 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hps5P59438 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hps5P59438 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hps5P59438 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hps5P59438 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hps5P59438 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hps5P59438 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hps5P59438 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hps5P59438 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hps5P59438 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hps5P59438 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hps5P59438 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hps5P59438 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hps5P59438 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hps5P59438 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hps5P59438 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hps5P59438 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hps5P59438 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hps5P59438 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hps5P59438 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hps5P59438 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hps5P59438 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hps5P59438 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hps5P59438 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hps5P59438 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hps5P59438 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hps5P59438 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hps5P59438 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hps5P59438 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hps5P59438 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hps5P59438 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hps5P59438 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hps5P59438 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hps5P59438 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hps5P59438 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hps5P59438 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hps5P59438 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hps5P59438 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hps5P59438 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hps5P59438 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms