Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms