Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TdgP56581 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TdgP56581 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TdgP56581 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TdgP56581 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TdgP56581 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TdgP56581 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TdgP56581 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TdgP56581 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TdgP56581 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TdgP56581 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TdgP56581 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TdgP56581 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TdgP56581 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TdgP56581 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TdgP56581 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TdgP56581 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TdgP56581 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TdgP56581 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TdgP56581 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TdgP56581 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TdgP56581 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TdgP56581 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TdgP56581 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TdgP56581 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TdgP56581 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TdgP56581 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TdgP56581 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TdgP56581 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TdgP56581 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TdgP56581 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TdgP56581 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TdgP56581 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TdgP56581 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TdgP56581 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TdgP56581 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TdgP56581 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TdgP56581 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TdgP56581 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TdgP56581 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TdgP56581 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TdgP56581 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TdgP56581 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TdgP56581 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TdgP56581 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TdgP56581 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TdgP56581 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TdgP56581 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TdgP56581 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TdgP56581 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TdgP56581 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TdgP56581 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TdgP56581 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TdgP56581 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TdgP56581 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TdgP56581 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TdgP56581 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TdgP56581 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TdgP56581 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TdgP56581 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TdgP56581 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TdgP56581 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TdgP56581 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TdgP56581 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TdgP56581 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TdgP56581 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TdgP56581 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TdgP56581 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TdgP56581 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TdgP56581 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TdgP56581 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TdgP56581 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TdgP56581 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TdgP56581 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TdgP56581 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TdgP56581 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TdgP56581 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TdgP56581 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TdgP56581 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TdgP56581 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TdgP56581 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TdgP56581 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TdgP56581 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TdgP56581 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TdgP56581 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TdgP56581 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TdgP56581 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TdgP56581 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TdgP56581 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TdgP56581 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TdgP56581 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TdgP56581 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TdgP56581 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TdgP56581 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TdgP56581 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TdgP56581 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TdgP56581 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TdgP56581 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TdgP56581 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TdgP56581 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms