Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CdaP56389 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CdaP56389 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CdaP56389 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CdaP56389 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CdaP56389 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CdaP56389 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CdaP56389 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CdaP56389 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CdaP56389 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CdaP56389 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CdaP56389 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CdaP56389 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CdaP56389 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CdaP56389 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CdaP56389 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CdaP56389 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CdaP56389 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CdaP56389 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CdaP56389 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CdaP56389 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CdaP56389 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CdaP56389 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CdaP56389 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CdaP56389 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CdaP56389 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CdaP56389 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CdaP56389 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CdaP56389 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CdaP56389 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CdaP56389 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CdaP56389 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CdaP56389 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CdaP56389 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CdaP56389 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CdaP56389 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CdaP56389 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CdaP56389 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CdaP56389 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CdaP56389 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CdaP56389 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CdaP56389 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CdaP56389 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CdaP56389 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CdaP56389 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CdaP56389 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CdaP56389 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CdaP56389 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CdaP56389 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CdaP56389 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CdaP56389 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CdaP56389 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CdaP56389 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CdaP56389 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CdaP56389 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CdaP56389 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CdaP56389 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CdaP56389 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CdaP56389 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CdaP56389 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CdaP56389 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CdaP56389 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CdaP56389 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CdaP56389 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CdaP56389 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CdaP56389 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CdaP56389 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CdaP56389 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CdaP56389 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CdaP56389 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CdaP56389 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CdaP56389 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CdaP56389 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CdaP56389 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CdaP56389 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CdaP56389 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CdaP56389 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CdaP56389 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CdaP56389 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CdaP56389 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CdaP56389 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CdaP56389 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CdaP56389 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CdaP56389 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CdaP56389 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CdaP56389 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CdaP56389 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CdaP56389 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CdaP56389 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CdaP56389 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CdaP56389 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CdaP56389 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CdaP56389 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CdaP56389 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CdaP56389 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CdaP56389 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CdaP56389 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CdaP56389 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CdaP56389 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CdaP56389 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms