Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rrp1P56183 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rrp1P56183 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms