Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtskP55097 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtskP55097 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtskP55097 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtskP55097 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtskP55097 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtskP55097 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtskP55097 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtskP55097 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtskP55097 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtskP55097 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtskP55097 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtskP55097 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtskP55097 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtskP55097 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtskP55097 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtskP55097 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtskP55097 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtskP55097 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtskP55097 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtskP55097 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CtskP55097 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CtskP55097 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtskP55097 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtskP55097 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtskP55097 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtskP55097 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtskP55097 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtskP55097 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtskP55097 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtskP55097 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtskP55097 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtskP55097 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtskP55097 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtskP55097 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtskP55097 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtskP55097 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtskP55097 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtskP55097 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtskP55097 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtskP55097 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CtskP55097 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CtskP55097 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtskP55097 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtskP55097 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtskP55097 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtskP55097 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtskP55097 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtskP55097 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtskP55097 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtskP55097 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtskP55097 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtskP55097 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtskP55097 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtskP55097 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtskP55097 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtskP55097 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtskP55097 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtskP55097 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtskP55097 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtskP55097 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtskP55097 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtskP55097 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CtskP55097 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtskP55097 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtskP55097 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtskP55097 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtskP55097 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtskP55097 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtskP55097 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtskP55097 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtskP55097 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtskP55097 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtskP55097 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CtskP55097 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CtskP55097 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CtskP55097 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CtskP55097 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CtskP55097 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CtskP55097 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CtskP55097 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CtskP55097 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtskP55097 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtskP55097 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtskP55097 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtskP55097 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtskP55097 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtskP55097 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtskP55097 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtskP55097 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtskP55097 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtskP55097 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtskP55097 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtskP55097 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtskP55097 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtskP55097 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtskP55097 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtskP55097 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtskP55097 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtskP55097 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms