Protein–RNA interactions for Protein: P53702

Hccs, Cytochrome c-type heme lyase, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HccsP53702 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HccsP53702 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HccsP53702 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HccsP53702 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HccsP53702 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HccsP53702 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HccsP53702 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HccsP53702 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HccsP53702 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HccsP53702 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HccsP53702 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HccsP53702 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HccsP53702 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HccsP53702 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HccsP53702 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HccsP53702 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HccsP53702 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HccsP53702 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HccsP53702 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HccsP53702 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HccsP53702 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HccsP53702 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HccsP53702 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HccsP53702 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HccsP53702 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HccsP53702 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HccsP53702 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HccsP53702 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HccsP53702 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HccsP53702 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HccsP53702 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HccsP53702 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HccsP53702 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HccsP53702 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HccsP53702 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HccsP53702 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HccsP53702 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
HccsP53702 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HccsP53702 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HccsP53702 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HccsP53702 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
HccsP53702 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HccsP53702 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HccsP53702 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HccsP53702 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HccsP53702 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HccsP53702 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HccsP53702 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HccsP53702 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HccsP53702 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HccsP53702 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HccsP53702 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HccsP53702 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HccsP53702 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HccsP53702 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HccsP53702 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HccsP53702 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HccsP53702 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HccsP53702 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HccsP53702 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HccsP53702 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HccsP53702 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HccsP53702 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HccsP53702 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HccsP53702 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HccsP53702 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HccsP53702 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HccsP53702 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HccsP53702 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HccsP53702 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HccsP53702 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HccsP53702 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HccsP53702 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HccsP53702 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HccsP53702 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HccsP53702 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HccsP53702 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HccsP53702 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HccsP53702 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HccsP53702 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HccsP53702 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HccsP53702 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HccsP53702 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HccsP53702 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HccsP53702 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HccsP53702 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HccsP53702 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HccsP53702 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HccsP53702 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HccsP53702 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HccsP53702 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HccsP53702 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HccsP53702 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HccsP53702 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HccsP53702 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HccsP53702 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HccsP53702 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HccsP53702 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HccsP53702 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HccsP53702 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms