Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RabggtbP53612 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms