Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Map3k1P53349 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Map3k1P53349 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Map3k1P53349 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Map3k1P53349 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Map3k1P53349 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Map3k1P53349 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Map3k1P53349 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Map3k1P53349 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Map3k1P53349 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Map3k1P53349 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Map3k1P53349 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Map3k1P53349 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Map3k1P53349 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Map3k1P53349 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Map3k1P53349 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Map3k1P53349 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Map3k1P53349 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Map3k1P53349 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Map3k1P53349 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Map3k1P53349 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Map3k1P53349 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Map3k1P53349 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Map3k1P53349 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Map3k1P53349 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Map3k1P53349 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Map3k1P53349 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Map3k1P53349 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Map3k1P53349 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Map3k1P53349 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Map3k1P53349 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Map3k1P53349 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Map3k1P53349 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Map3k1P53349 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Map3k1P53349 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Map3k1P53349 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Map3k1P53349 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Map3k1P53349 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Map3k1P53349 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Map3k1P53349 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Map3k1P53349 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Map3k1P53349 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Map3k1P53349 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Map3k1P53349 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Map3k1P53349 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Map3k1P53349 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Map3k1P53349 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Map3k1P53349 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Map3k1P53349 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Map3k1P53349 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Map3k1P53349 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Map3k1P53349 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Map3k1P53349 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Map3k1P53349 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Map3k1P53349 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Map3k1P53349 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Map3k1P53349 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Map3k1P53349 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Map3k1P53349 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Map3k1P53349 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Map3k1P53349 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms