Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Upp1P52624 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Upp1P52624 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Upp1P52624 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Upp1P52624 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Upp1P52624 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Upp1P52624 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Upp1P52624 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Upp1P52624 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Upp1P52624 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Upp1P52624 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Upp1P52624 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms