Protein–RNA interactions for Protein: P51885

Lum, Lumican, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LumP51885 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LumP51885 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LumP51885 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LumP51885 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LumP51885 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LumP51885 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LumP51885 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LumP51885 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LumP51885 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LumP51885 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LumP51885 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LumP51885 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LumP51885 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LumP51885 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LumP51885 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LumP51885 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LumP51885 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LumP51885 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LumP51885 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LumP51885 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LumP51885 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LumP51885 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LumP51885 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LumP51885 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LumP51885 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LumP51885 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LumP51885 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LumP51885 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LumP51885 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LumP51885 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LumP51885 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LumP51885 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LumP51885 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LumP51885 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LumP51885 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LumP51885 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LumP51885 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LumP51885 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LumP51885 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LumP51885 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LumP51885 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LumP51885 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LumP51885 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LumP51885 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LumP51885 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LumP51885 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LumP51885 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LumP51885 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LumP51885 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LumP51885 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LumP51885 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LumP51885 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LumP51885 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LumP51885 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LumP51885 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LumP51885 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LumP51885 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LumP51885 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LumP51885 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LumP51885 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LumP51885 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LumP51885 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LumP51885 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LumP51885 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LumP51885 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LumP51885 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LumP51885 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LumP51885 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LumP51885 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LumP51885 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LumP51885 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LumP51885 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LumP51885 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LumP51885 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LumP51885 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LumP51885 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LumP51885 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LumP51885 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LumP51885 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LumP51885 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
LumP51885 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LumP51885 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LumP51885 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LumP51885 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LumP51885 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LumP51885 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LumP51885 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LumP51885 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LumP51885 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LumP51885 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LumP51885 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LumP51885 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LumP51885 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LumP51885 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LumP51885 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LumP51885 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LumP51885 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LumP51885 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LumP51885 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LumP51885 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms