Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccr5P51682 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms