Protein–RNA interactions for Protein: P51450

Rorc, Nuclear receptor ROR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorcP51450 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RorcP51450 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RorcP51450 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RorcP51450 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RorcP51450 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RorcP51450 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RorcP51450 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RorcP51450 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RorcP51450 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RorcP51450 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RorcP51450 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RorcP51450 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RorcP51450 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RorcP51450 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RorcP51450 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RorcP51450 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RorcP51450 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RorcP51450 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RorcP51450 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RorcP51450 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RorcP51450 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RorcP51450 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RorcP51450 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RorcP51450 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RorcP51450 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RorcP51450 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RorcP51450 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RorcP51450 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RorcP51450 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RorcP51450 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RorcP51450 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RorcP51450 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RorcP51450 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RorcP51450 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RorcP51450 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RorcP51450 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RorcP51450 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RorcP51450 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RorcP51450 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RorcP51450 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RorcP51450 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RorcP51450 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RorcP51450 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RorcP51450 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RorcP51450 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RorcP51450 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RorcP51450 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RorcP51450 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RorcP51450 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RorcP51450 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RorcP51450 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RorcP51450 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RorcP51450 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RorcP51450 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RorcP51450 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RorcP51450 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RorcP51450 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RorcP51450 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RorcP51450 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RorcP51450 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RorcP51450 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RorcP51450 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RorcP51450 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RorcP51450 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RorcP51450 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RorcP51450 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RorcP51450 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RorcP51450 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RorcP51450 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RorcP51450 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RorcP51450 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RorcP51450 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RorcP51450 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RorcP51450 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RorcP51450 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RorcP51450 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RorcP51450 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RorcP51450 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RorcP51450 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RorcP51450 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RorcP51450 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RorcP51450 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RorcP51450 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RorcP51450 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RorcP51450 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RorcP51450 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RorcP51450 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RorcP51450 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RorcP51450 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RorcP51450 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RorcP51450 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RorcP51450 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RorcP51450 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RorcP51450 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RorcP51450 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RorcP51450 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RorcP51450 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RorcP51450 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RorcP51450 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RorcP51450 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms