Protein–RNA interactions for Protein: P51180

Mip, Lens fiber major intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MipP51180 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MipP51180 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MipP51180 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MipP51180 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MipP51180 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MipP51180 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MipP51180 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MipP51180 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MipP51180 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MipP51180 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MipP51180 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MipP51180 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MipP51180 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MipP51180 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MipP51180 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MipP51180 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MipP51180 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MipP51180 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MipP51180 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MipP51180 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MipP51180 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MipP51180 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MipP51180 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MipP51180 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MipP51180 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MipP51180 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MipP51180 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MipP51180 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MipP51180 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MipP51180 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MipP51180 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MipP51180 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MipP51180 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MipP51180 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MipP51180 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MipP51180 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MipP51180 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MipP51180 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MipP51180 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MipP51180 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MipP51180 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MipP51180 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MipP51180 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MipP51180 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MipP51180 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MipP51180 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MipP51180 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MipP51180 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MipP51180 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MipP51180 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MipP51180 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MipP51180 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MipP51180 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MipP51180 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MipP51180 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MipP51180 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MipP51180 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MipP51180 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MipP51180 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MipP51180 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MipP51180 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MipP51180 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MipP51180 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MipP51180 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
MipP51180 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MipP51180 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MipP51180 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MipP51180 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MipP51180 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MipP51180 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MipP51180 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MipP51180 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MipP51180 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MipP51180 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MipP51180 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MipP51180 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MipP51180 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MipP51180 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MipP51180 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MipP51180 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MipP51180 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MipP51180 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MipP51180 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MipP51180 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MipP51180 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MipP51180 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MipP51180 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MipP51180 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MipP51180 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MipP51180 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MipP51180 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MipP51180 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MipP51180 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MipP51180 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MipP51180 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MipP51180 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MipP51180 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MipP51180 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MipP51180 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MipP51180 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms