Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tmod1P49813 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms