Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TgfaP48030 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TgfaP48030 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TgfaP48030 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TgfaP48030 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TgfaP48030 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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