Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gli1P47806 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gli1P47806 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gli1P47806 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gli1P47806 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gli1P47806 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gli1P47806 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gli1P47806 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gli1P47806 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gli1P47806 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gli1P47806 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gli1P47806 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gli1P47806 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gli1P47806 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gli1P47806 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gli1P47806 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gli1P47806 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gli1P47806 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gli1P47806 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gli1P47806 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gli1P47806 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gli1P47806 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gli1P47806 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gli1P47806 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gli1P47806 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gli1P47806 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gli1P47806 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gli1P47806 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gli1P47806 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gli1P47806 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gli1P47806 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gli1P47806 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gli1P47806 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gli1P47806 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gli1P47806 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gli1P47806 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gli1P47806 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gli1P47806 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gli1P47806 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gli1P47806 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gli1P47806 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gli1P47806 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gli1P47806 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gli1P47806 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gli1P47806 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gli1P47806 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gli1P47806 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gli1P47806 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gli1P47806 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gli1P47806 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gli1P47806 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gli1P47806 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms