Protein–RNA interactions for Protein: P43687

Hmx2, Homeobox protein HMX2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx2P43687 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmx2P43687 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms