Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ItgavP43406 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ItgavP43406 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ItgavP43406 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ItgavP43406 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ItgavP43406 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms