Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtgfrP43117 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtgfrP43117 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtgfrP43117 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtgfrP43117 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtgfrP43117 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtgfrP43117 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtgfrP43117 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtgfrP43117 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PtgfrP43117 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PtgfrP43117 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtgfrP43117 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtgfrP43117 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtgfrP43117 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtgfrP43117 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtgfrP43117 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtgfrP43117 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtgfrP43117 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtgfrP43117 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PtgfrP43117 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtgfrP43117 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtgfrP43117 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PtgfrP43117 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtgfrP43117 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtgfrP43117 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtgfrP43117 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtgfrP43117 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PtgfrP43117 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtgfrP43117 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtgfrP43117 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtgfrP43117 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtgfrP43117 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtgfrP43117 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtgfrP43117 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtgfrP43117 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtgfrP43117 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtgfrP43117 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtgfrP43117 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtgfrP43117 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtgfrP43117 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtgfrP43117 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtgfrP43117 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PtgfrP43117 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtgfrP43117 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtgfrP43117 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtgfrP43117 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PtgfrP43117 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PtgfrP43117 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PtgfrP43117 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtgfrP43117 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtgfrP43117 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtgfrP43117 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtgfrP43117 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtgfrP43117 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtgfrP43117 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtgfrP43117 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtgfrP43117 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PtgfrP43117 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PtgfrP43117 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PtgfrP43117 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PtgfrP43117 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PtgfrP43117 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PtgfrP43117 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PtgfrP43117 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PtgfrP43117 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PtgfrP43117 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtgfrP43117 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtgfrP43117 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtgfrP43117 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtgfrP43117 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtgfrP43117 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtgfrP43117 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtgfrP43117 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtgfrP43117 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtgfrP43117 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtgfrP43117 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtgfrP43117 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtgfrP43117 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtgfrP43117 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtgfrP43117 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtgfrP43117 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtgfrP43117 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtgfrP43117 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtgfrP43117 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtgfrP43117 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtgfrP43117 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtgfrP43117 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtgfrP43117 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtgfrP43117 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtgfrP43117 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtgfrP43117 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtgfrP43117 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtgfrP43117 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtgfrP43117 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtgfrP43117 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtgfrP43117 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtgfrP43117 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtgfrP43117 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtgfrP43117 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtgfrP43117 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms