Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lig1P37913 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lig1P37913 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lig1P37913 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms