Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PtprkP35822 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PtprkP35822 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PtprkP35822 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PtprkP35822 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PtprkP35822 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PtprkP35822 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PtprkP35822 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PtprkP35822 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PtprkP35822 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PtprkP35822 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PtprkP35822 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PtprkP35822 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PtprkP35822 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PtprkP35822 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PtprkP35822 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PtprkP35822 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PtprkP35822 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PtprkP35822 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PtprkP35822 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PtprkP35822 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PtprkP35822 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PtprkP35822 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PtprkP35822 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PtprkP35822 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PtprkP35822 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PtprkP35822 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PtprkP35822 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PtprkP35822 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtprkP35822 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtprkP35822 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtprkP35822 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtprkP35822 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtprkP35822 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtprkP35822 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtprkP35822 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtprkP35822 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtprkP35822 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtprkP35822 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtprkP35822 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtprkP35822 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtprkP35822 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PtprkP35822 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtprkP35822 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtprkP35822 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtprkP35822 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtprkP35822 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtprkP35822 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtprkP35822 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtprkP35822 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtprkP35822 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtprkP35822 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtprkP35822 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtprkP35822 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtprkP35822 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtprkP35822 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PtprkP35822 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PtprkP35822 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PtprkP35822 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PtprkP35822 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PtprkP35822 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PtprkP35822 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PtprkP35822 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PtprkP35822 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PtprkP35822 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PtprkP35822 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PtprkP35822 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PtprkP35822 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PtprkP35822 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PtprkP35822 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PtprkP35822 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PtprkP35822 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PtprkP35822 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PtprkP35822 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PtprkP35822 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PtprkP35822 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PtprkP35822 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PtprkP35822 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PtprkP35822 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PtprkP35822 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PtprkP35822 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PtprkP35822 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms