Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rfc1P35601 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rfc1P35601 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms