Protein–RNA interactions for Protein: P35546

Ret, Proto-oncogene tyrosine-protein kinase receptor Ret, mousemouse

Predictions only

Length 1,115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RetP35546 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RetP35546 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RetP35546 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RetP35546 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RetP35546 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RetP35546 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RetP35546 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RetP35546 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RetP35546 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RetP35546 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RetP35546 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RetP35546 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RetP35546 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RetP35546 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RetP35546 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RetP35546 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RetP35546 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RetP35546 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RetP35546 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RetP35546 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RetP35546 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RetP35546 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RetP35546 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RetP35546 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RetP35546 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RetP35546 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RetP35546 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RetP35546 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RetP35546 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RetP35546 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RetP35546 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RetP35546 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RetP35546 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RetP35546 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RetP35546 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RetP35546 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RetP35546 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RetP35546 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RetP35546 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RetP35546 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RetP35546 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RetP35546 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RetP35546 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RetP35546 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RetP35546 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RetP35546 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RetP35546 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RetP35546 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RetP35546 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RetP35546 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RetP35546 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RetP35546 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RetP35546 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RetP35546 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RetP35546 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RetP35546 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RetP35546 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RetP35546 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RetP35546 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RetP35546 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RetP35546 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RetP35546 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RetP35546 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RetP35546 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RetP35546 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RetP35546 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RetP35546 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RetP35546 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RetP35546 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RetP35546 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RetP35546 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RetP35546 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RetP35546 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RetP35546 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RetP35546 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RetP35546 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RetP35546 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RetP35546 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RetP35546 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RetP35546 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RetP35546 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RetP35546 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RetP35546 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RetP35546 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RetP35546 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RetP35546 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RetP35546 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RetP35546 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RetP35546 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RetP35546 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RetP35546 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RetP35546 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RetP35546 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RetP35546 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RetP35546 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RetP35546 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RetP35546 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RetP35546 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RetP35546 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RetP35546 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms