Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms