Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptpn11P35235 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms