Protein–RNA interactions for Protein: P30416

Fkbp4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fkbp4P30416 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fkbp4P30416 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Fkbp4P30416 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Fkbp4P30416 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fkbp4P30416 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fkbp4P30416 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fkbp4P30416 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fkbp4P30416 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fkbp4P30416 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fkbp4P30416 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fkbp4P30416 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fkbp4P30416 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fkbp4P30416 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Fkbp4P30416 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fkbp4P30416 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fkbp4P30416 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fkbp4P30416 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fkbp4P30416 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fkbp4P30416 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Fkbp4P30416 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fkbp4P30416 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fkbp4P30416 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fkbp4P30416 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Fkbp4P30416 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Fkbp4P30416 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fkbp4P30416 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fkbp4P30416 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fkbp4P30416 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Fkbp4P30416 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Fkbp4P30416 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Fkbp4P30416 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fkbp4P30416 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fkbp4P30416 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fkbp4P30416 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fkbp4P30416 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fkbp4P30416 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fkbp4P30416 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fkbp4P30416 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fkbp4P30416 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fkbp4P30416 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fkbp4P30416 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fkbp4P30416 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Fkbp4P30416 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fkbp4P30416 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fkbp4P30416 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fkbp4P30416 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fkbp4P30416 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fkbp4P30416 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fkbp4P30416 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fkbp4P30416 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fkbp4P30416 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fkbp4P30416 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fkbp4P30416 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fkbp4P30416 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fkbp4P30416 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Fkbp4P30416 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fkbp4P30416 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Fkbp4P30416 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fkbp4P30416 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fkbp4P30416 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fkbp4P30416 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fkbp4P30416 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fkbp4P30416 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fkbp4P30416 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fkbp4P30416 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fkbp4P30416 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fkbp4P30416 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fkbp4P30416 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fkbp4P30416 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fkbp4P30416 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fkbp4P30416 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Fkbp4P30416 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fkbp4P30416 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fkbp4P30416 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fkbp4P30416 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fkbp4P30416 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fkbp4P30416 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fkbp4P30416 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fkbp4P30416 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fkbp4P30416 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fkbp4P30416 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fkbp4P30416 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fkbp4P30416 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Fkbp4P30416 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fkbp4P30416 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fkbp4P30416 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fkbp4P30416 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fkbp4P30416 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fkbp4P30416 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fkbp4P30416 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fkbp4P30416 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fkbp4P30416 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fkbp4P30416 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fkbp4P30416 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fkbp4P30416 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fkbp4P30416 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fkbp4P30416 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Fkbp4P30416 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fkbp4P30416 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fkbp4P30416 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms