Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VtnP29788 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
VtnP29788 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VtnP29788 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VtnP29788 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VtnP29788 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VtnP29788 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VtnP29788 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VtnP29788 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VtnP29788 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VtnP29788 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VtnP29788 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VtnP29788 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VtnP29788 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VtnP29788 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VtnP29788 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VtnP29788 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VtnP29788 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VtnP29788 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VtnP29788 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VtnP29788 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VtnP29788 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VtnP29788 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VtnP29788 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VtnP29788 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VtnP29788 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VtnP29788 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VtnP29788 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VtnP29788 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VtnP29788 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VtnP29788 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VtnP29788 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VtnP29788 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VtnP29788 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VtnP29788 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VtnP29788 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VtnP29788 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VtnP29788 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VtnP29788 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
VtnP29788 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VtnP29788 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VtnP29788 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VtnP29788 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VtnP29788 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VtnP29788 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VtnP29788 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VtnP29788 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
VtnP29788 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VtnP29788 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VtnP29788 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VtnP29788 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VtnP29788 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VtnP29788 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VtnP29788 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VtnP29788 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
VtnP29788 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VtnP29788 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
VtnP29788 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VtnP29788 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VtnP29788 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VtnP29788 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VtnP29788 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VtnP29788 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VtnP29788 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VtnP29788 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VtnP29788 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VtnP29788 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VtnP29788 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VtnP29788 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VtnP29788 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VtnP29788 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VtnP29788 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VtnP29788 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VtnP29788 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VtnP29788 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VtnP29788 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VtnP29788 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VtnP29788 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VtnP29788 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VtnP29788 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VtnP29788 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VtnP29788 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VtnP29788 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VtnP29788 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VtnP29788 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VtnP29788 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VtnP29788 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VtnP29788 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VtnP29788 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VtnP29788 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VtnP29788 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VtnP29788 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VtnP29788 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VtnP29788 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VtnP29788 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VtnP29788 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VtnP29788 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VtnP29788 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VtnP29788 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VtnP29788 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms