Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pabpc1P29341 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pabpc1P29341 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pabpc1P29341 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pabpc1P29341 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pabpc1P29341 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pabpc1P29341 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pabpc1P29341 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pabpc1P29341 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pabpc1P29341 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pabpc1P29341 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pabpc1P29341 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pabpc1P29341 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pabpc1P29341 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pabpc1P29341 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pabpc1P29341 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pabpc1P29341 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pabpc1P29341 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pabpc1P29341 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pabpc1P29341 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pabpc1P29341 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pabpc1P29341 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pabpc1P29341 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pabpc1P29341 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pabpc1P29341 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pabpc1P29341 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pabpc1P29341 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pabpc1P29341 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pabpc1P29341 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pabpc1P29341 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pabpc1P29341 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pabpc1P29341 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pabpc1P29341 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pabpc1P29341 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pabpc1P29341 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pabpc1P29341 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pabpc1P29341 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pabpc1P29341 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pabpc1P29341 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pabpc1P29341 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pabpc1P29341 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pabpc1P29341 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pabpc1P29341 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pabpc1P29341 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pabpc1P29341 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pabpc1P29341 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pabpc1P29341 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pabpc1P29341 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pabpc1P29341 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pabpc1P29341 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pabpc1P29341 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pabpc1P29341 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pabpc1P29341 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pabpc1P29341 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pabpc1P29341 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pabpc1P29341 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pabpc1P29341 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pabpc1P29341 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pabpc1P29341 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pabpc1P29341 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pabpc1P29341 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms