Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms