Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NefhP19246 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NefhP19246 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NefhP19246 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NefhP19246 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NefhP19246 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NefhP19246 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
NefhP19246 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NefhP19246 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NefhP19246 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NefhP19246 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NefhP19246 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NefhP19246 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NefhP19246 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NefhP19246 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NefhP19246 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NefhP19246 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NefhP19246 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NefhP19246 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NefhP19246 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NefhP19246 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NefhP19246 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NefhP19246 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NefhP19246 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
NefhP19246 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
NefhP19246 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NefhP19246 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NefhP19246 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NefhP19246 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NefhP19246 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
NefhP19246 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NefhP19246 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NefhP19246 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NefhP19246 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NefhP19246 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NefhP19246 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NefhP19246 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NefhP19246 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NefhP19246 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NefhP19246 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NefhP19246 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NefhP19246 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NefhP19246 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NefhP19246 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NefhP19246 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NefhP19246 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
NefhP19246 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NefhP19246 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NefhP19246 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NefhP19246 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NefhP19246 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NefhP19246 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NefhP19246 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NefhP19246 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NefhP19246 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
NefhP19246 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
NefhP19246 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NefhP19246 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
NefhP19246 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NefhP19246 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NefhP19246 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NefhP19246 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NefhP19246 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NefhP19246 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NefhP19246 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NefhP19246 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NefhP19246 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NefhP19246 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NefhP19246 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NefhP19246 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NefhP19246 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NefhP19246 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NefhP19246 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NefhP19246 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NefhP19246 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NefhP19246 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NefhP19246 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NefhP19246 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NefhP19246 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NefhP19246 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NefhP19246 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NefhP19246 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NefhP19246 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NefhP19246 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NefhP19246 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NefhP19246 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NefhP19246 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NefhP19246 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NefhP19246 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NefhP19246 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NefhP19246 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NefhP19246 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NefhP19246 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NefhP19246 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NefhP19246 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NefhP19246 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NefhP19246 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NefhP19246 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NefhP19246 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NefhP19246 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms