Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms