Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18533 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18533 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18533 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18533 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P18533 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18533 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18533 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18533 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18533 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P18533 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18533 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18533 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18533 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18533 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18533 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18533 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18533 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18533 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18533 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18533 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18533 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18533 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18533 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18533 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18533 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18533 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18533 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18533 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18533 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18533 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18533 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18533 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P18533 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18533 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18533 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18533 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P18533 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18533 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18533 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18533 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18533 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18533 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18533 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18533 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18533 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18533 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18533 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18533 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P18533 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18533 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18533 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18533 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18533 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18533 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P18533 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18533 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18533 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18533 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18533 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18533 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18533 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18533 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18533 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18533 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18533 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18533 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18533 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18533 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18533 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18533 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P18533 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P18533 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P18533 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P18533 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P18533 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P18533 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P18533 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P18533 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P18533 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
P18533 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P18533 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P18533 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
P18533 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P18533 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P18533 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P18533 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P18533 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P18533 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P18533 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P18533 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P18533 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P18533 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P18533 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P18533 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P18533 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P18533 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P18533 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P18533 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P18533 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms