Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtpraP18052 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtpraP18052 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtpraP18052 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtpraP18052 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PtpraP18052 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtpraP18052 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtpraP18052 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtpraP18052 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtpraP18052 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms