Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pou4f1P17208 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou4f1P17208 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms