Protein–RNA interactions for Protein: P16054

Prkce, Protein kinase C epsilon type, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkceP16054 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkceP16054 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkceP16054 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkceP16054 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkceP16054 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkceP16054 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkceP16054 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkceP16054 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkceP16054 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkceP16054 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms