Protein–RNA interactions for Protein: P15532

Nme1, Nucleoside diphosphate kinase A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme1P15532 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme1P15532 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme1P15532 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme1P15532 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme1P15532 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme1P15532 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme1P15532 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme1P15532 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme1P15532 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme1P15532 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme1P15532 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme1P15532 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Nme1P15532 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme1P15532 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme1P15532 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme1P15532 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme1P15532 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nme1P15532 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nme1P15532 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nme1P15532 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms