Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lmnb1P14733 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmnb1P14733 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms